成功案例– Prognosys Biosciences

Prognosys横幅

Zmanda保护生物技术数据

大量的分子数据对于Prognosys Biosciences是至关重要的库存,Prognosys Biosciences是一家位于加利福尼亚州拉霍亚的生物技术公司。 从DNA测序仪收集的数据驻留在RAID存储服务器上,该服务器具有大约20TB的可用存储空间。

Prognosys Biosciences徽标| Zmanda

Prognosys博士Mike Thompson博士说:“数据对公司至关重要,需要保护它免受设备故障和其他风险的影响。”

人类基因组有XNUMX亿个碱基对。 碱基序列决定了人与人之间的差异,有关这些差异的信息用于改善医学和了解特定药物的作用。 Prognosys使用一种称为Illumina Genome Analyzer II的测序仪,该测序仪可为基因组学,表观基因组学,基因表达分析和蛋白质-核酸相互作用的发现提供结果。 测序仪器的每次运行都会产生近TB的数据。 一旦收集,原始数据就不会改变。 动态数据来自对原始数据进行的计算。

开源备份进入

最近,随着Prognosys扩大内部项目及其排序服务的运行速度,很明显,需要一个可靠的备份和恢复系统。 对专有的备份和恢复软件产品以及Zmanda的开源软件进行了研究,以备份不变的原始测序数据和从计算分析得出的动态数据。

选择Zmanda的决定因素 阿曼达企业 价格包括:Backup Server软件和Solaris Client:价格(Amanda Enterprise Backup Server比专有软件便宜80%); 在客户端或服务器上加密数据的能力; 开放源代码的可访问性; 以及对客户支持的承诺。

“在将数据写入磁带之前,我们会将数据压缩大约70%。 如果将来Zmanda软件发生任何问题并且我们无法使用它,我们可以使用常规gzip解压缩数据。” Thompson说。 “ Zmanda将软件远程安装在备份服务器和存储服务器上,对其进行了测试,并确保我们对该产品感到满意。 我们与他们进行的价格互动是无与伦比的。”

在安装过程中,Zmanda的技术人员除了帮助公司更有效地备份原始数据集外,还帮助Prognosys克服了一些网络难题。 Zmanda技术人员帮助Prognosys增加了备份服务器和存储服务器之间的带宽,以便Prognosys可以更有效地利用其智能调度功能的功能,从而在计算机收集数据时保持较低的网络流量。

汤普森说:“原始数据集的静态备份是Zmanda的新功能。” “他们编写了一个脚本来自动执行备份,不仅了解他们过去的工作。 Zmanda的工程师不遗余力地开发了对我们有用的解决方案。”

Zmanda驯服静态和动态数据

Prognosys Biosciences网络由Linux,Solaris和Mac OS X服务器和客户端组成。 科学仪器连接到Windows客户端。

计算在Linux服务器上进行,该服务器分析来自Illumina Genome Analyzer II的数据,并将序列数据与人类基因组和其他基因组进行比对。 Genome Analyzer II每次运行可产生50万个36个碱基的读数。

Dell PowerEdge 2950用作备份服务器。 2950具有四核Xeon处理器,1.5TB容量和Red Hat Enterprise Linux5。它连接到运行Solaris的Sun Fire X4500 RAID存储服务器,该服务器每天备份数据,并在数据装满后转储到Dell PowerVault ML600磁带图书馆。

戴尔磁带库有36个插槽,用于800GB LTO磁带。 动态数据填充了四个磁带,这些磁带每四个星期循环一次。 其他磁带专用于备份原始数据。 Prognosys使用Illumina Genome Analyzer II完成运行后,会将数据写入磁带。 备份磁带将发送到异地安全存储。

原始数据集的平均每周备份大小为500 TB,动态数据的平均每日备份大小为2.5GB左右。 每周对磁带进行完整备份的平均时间为七个小时。 动态数据到磁盘的增量备份平均需要XNUMX个小时。

Prognosys Biosciences利用Zmanda放心

自从实施Zmanda的软件以来,Prognosys便能够扩大操作规模而不会造成数据丢失的风险。 Amanda Enterprise解决方案使Prognosys可以扩展其环境并根据需要继续添加客户端。 在不久的将来,Prognosys计划增加更多的计算能力,并可能增加更多的存储服务器。

自实施以来,Prognosys已备份了大约20TB。 汤普森还对修复进行了测试。 将数据转储到磁带后,将在Amanda Enterprise中选择一个“还原”选项卡。 Amanda Enterprise拥有一个数据库,其中包含有关已备份的所有目录和文件的信息。 用户请求在特定时间段恢复,Amanda Enterprise告诉用户要加载哪个磁带。 服务器负载和服务器与客户端之间的带宽都得到了改善。

“我们非常喜欢Zmanda备份软件的另一件事是它是一个Web应用程序,” Thompson说。 “我们可以监视网络上任何计算机的备份进度。”

此外,Web应用程序界面允许由非技术人员管理备份。 对于没有专门的存储管理员的公司来说,这是一个加号。

对于处理大量数据的公司, 强大而可靠的备份和恢复 成功所必需的。 来自各种垂直市场的公司正在通过灵活的开源解决方案而不是过度设计,昂贵的专有软件来成功地保护其数据资产。

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