Kisah Kejayaan - Prognosys Biosciences
Zmanda melindungi data bioteknologi
Sejumlah besar data molekul adalah inventori penting untuk Prognosys Biosciences, sebuah syarikat bioteknologi yang berpusat di La Jolla, CA. Data, yang dikumpulkan dari sequencer DNA, berada di pelayan penyimpanan RAID yang mempunyai ruang penyimpanan kira-kira 20 TB.
"Data sangat penting bagi syarikat, dan perlu dilindungi dari kegagalan peralatan dan risiko lain," kata Dr Mike Thompson, Ph.D., Prognosys.
Genom manusia mempunyai tiga bilion pasangan asas. Urutan asas menentukan perbezaan antara orang, dan maklumat mengenai perbezaan ini digunakan untuk meningkatkan perubatan dan untuk memahami kesan ubat-ubatan tertentu. Prognosys menggunakan penjujukan yang disebut Illumina Genome Analyzer II, yang menghasilkan hasil penemuan dalam genomik, epigenomik, analisis ekspresi gen, dan interaksi asid-nukleik protein. Setiap larian instrumen penjujukan menghasilkan hampir satu terabait data. Setelah dikumpulkan, data mentah tidak berubah. Data dinamik terhasil dari pengiraan yang dilakukan pada data mentah.
Sandaran sumber terbuka bergerak masuk
Baru-baru ini, ketika Prognosys meningkatkan kedua-dua projek dalaman dan operasi perkhidmatan penjujukannya, menjadi jelas bahawa sistem sandaran dan pemulihan yang kuat diperlukan. Produk perisian sandaran dan pemulihan proprietari dan juga perisian sumber terbuka Zmanda diteliti untuk mendapatkan cadangan data urutan mentah yang tidak berubah dan data dinamik yang berasal dari analisis komputasi.
Faktor penentu dalam memilih Zmanda Amanda Enterprise Perisian Backup Server dan Solaris Client termasuk: harga (Amanda Enterprise Backup Server 80 peratus lebih rendah daripada perisian proprietari); keupayaan untuk menyulitkan data pada pelanggan atau pelayan; kebolehcapaian kod sumber terbuka; dan janji sokongan pelanggan.
"Kami memampatkan data sekitar 70 persen sebelum ditulis ke kaset. Sekiranya ada yang berlaku pada perisian Zmanda di jalan dan kami tidak dapat menggunakannya, kami dapat menggunakan gzip biasa untuk mengeluarkan data, ”kata Thompson. "Zmanda memasang perisian dari jauh ke pelayan sandaran dan pelayan penyimpanan, mengujinya, dan memastikan kami selesa dengan produk tersebut. Interaksi yang kami lakukan dengan mereka dengan harganya tidak terkalahkan. "
Semasa pemasangan, juruteknik Zmanda membantu Prognosys mengatasi beberapa cabaran rangkaian selain membolehkan syarikat membuat cadangan set data mentah dengan lebih cekap. Juruteknik Zmanda membantu Prognosys meningkatkan lebar jalur antara pelayan sandaran dan pelayan penyimpanan sehingga Prognosys dapat memanfaatkan kekuatan penjadualan pintarnya dengan lebih berkesan, yang membuat lalu lintas rangkaian tetap rendah semasa mesin mengumpulkan data.
"Sandaran statik set data mentah baru bagi Zmanda," kata Thompson. "Mereka menulis skrip untuk mengotomatiskan cadangan mereka dan tidak hanya berpengetahuan dalam apa yang biasa mereka lakukan. Jurutera Zmanda berusaha keras untuk mengembangkan penyelesaian yang sesuai untuk kita. "
Zmanda menjinakkan data statik dan dinamik
Rangkaian Prognosys Biosciences terdiri daripada pelayan dan klien Linux, Solaris, dan Mac OS X. Instrumen saintifik berhubung dengan pelanggan Windows.
Pengiraan berlaku pada pelayan Linux, yang menganalisis data dari Illumina Genome Analyzer II dan menyelaraskan data urutan terhadap genom manusia dan lain-lain. Genome Analyzer II menghasilkan 50 juta bacaan 36 asas setiap larian.
Dell PowerEdge 2950 berfungsi sebagai pelayan sandaran. 2950 mempunyai pemproses quad-core Xeon, kapasiti 1.5TB, dan Red Hat Enterprise Linux 5. Ia menghubungkan ke pelayan penyimpanan RAID Sun Fire X4500 yang menjalankan Solaris, yang menyandarkan data setiap hari dan membuangnya apabila penuh ke pita Dell PowerVault ML600 perpustakaan.
Perpustakaan Dell mempunyai 36 slot untuk kaset LTO 800GB. Data dinamik mengisi empat pita yang dikitar semula dalam putaran empat minggu. Pita lain dikhaskan untuk sandaran data mentah. Setelah Prognosys selesai menjalankan dengan Illumina Genome Analyzer II, ia menulis data ke kaset. Pita sandaran dihantar ke storan selamat di luar lokasi.
Ukuran sandaran mingguan rata-rata untuk set data mentah adalah satu terabait dan ukuran sandaran harian purata untuk data dinamik adalah sekitar 500GB. Masa purata untuk perekaman sandaran penuh mingguan adalah tujuh jam. Cadangan tambahan data dinamik ke cakera rata-rata 2.5 jam.
Prognosys Biosciences memanfaatkan Zmanda untuk ketenangan fikiran
Sejak melaksanakan perisian Zmanda, Prognosys dapat meningkatkan operasi tanpa risiko kehilangan data. Penyelesaian Amanda Enterprise membolehkan Prognosys mengembangkan persekitarannya dan terus menambah pelanggan mengikut keperluan. Dalam masa terdekat, Prognosys merancang untuk menambahkan lebih banyak kapasiti pengkomputeran dan mungkin lebih banyak pelayan storan.
Prognosys telah menyokong sekitar 20 TB sejak pelaksanaannya. Thompson juga telah menguji pemulihannya. Setelah data dibuang ke pita, tab pemulihan dipilih di Amanda Enterprise. Amanda Enterprise menyimpan pangkalan data yang mengandungi maklumat mengenai semua direktori dan fail yang telah disandarkan. Pengguna meminta pemulihan dari jangka waktu tertentu dan Amanda Enterprise memberitahu pengguna pita mana yang akan dimuat. Beban pelayan telah bertambah baik seperti juga lebar jalur antara pelayan dan klien.
"Perkara lain yang sangat kami sukai mengenai perisian sandaran Zmanda adalah bahawa ia adalah aplikasi Web," kata Thompson. "Kami dapat memantau kemajuan cadangan dari mesin mana pun di rangkaian."
Sebagai tambahan, antara muka aplikasi Web membolehkan sandaran diberikan oleh kakitangan bukan teknikal. Ini adalah kelebihan untuk syarikat tanpa pentadbir penyimpanan khusus.
Bagi syarikat yang memproses sejumlah besar data, sandaran dan pemulihan yang kuat dan boleh dipercayai diperlukan untuk berjaya. Syarikat-syarikat dari pelbagai pasaran menegak berjaya melindungi aset data mereka dengan penyelesaian sumber terbuka yang pantas daripada perisian proprietari mahal yang direkayasa.